CP2K

CP2K是一个量子化学和固态物理软件包，可以对固态，液态，分子，周期性，材料， 晶体和生物系统进行原子模拟。CP2K为不同的建模方法提供了通用框架。支持的理论 水平包括DFTB，LDA，GGA，MP2，RPA，半经验方法（AM1，PM3，PM6，RM1， MNDO等）和经典力场（AMBER，CHARMM等）。CP2K可以使用NEB或二聚体方法 进行分子动力学，元动力学，蒙特卡洛，埃伦菲斯特动力学，振动分析，核心能谱， 能量最小化和过渡态优化的模拟。

一. 命令行提交步骤

通过SSH连接创建并连接管理节点。

Step 1. 创建作业目录并进入；

mkdir cp2kJob1
cd cp2kJob1

Step 2. 通过文件传输上传所需的输入文件，详情请查看Linux数据传输；

Step 3. 在该文件夹下创建如下执行脚本cp2k.sh：

#!/bin/bash
# CP2K 2026.1 psmp — c-80-4 队列、2 节点（共 160 核）
# 实测最快配置：每节点 16 进程 × 5 线程（比纯 160 进程快约 2.3 倍）

module add CP2K/2026.1-foss-2025b

# 混合并行：每进程 5 个 OpenMP 线程
export OMP_NUM_THREADS=5
export OMP_PLACES=cores
export OMP_PROC_BIND=close

# 每节点 16 进程、每进程绑定 5 核（16×5=80 占满单节点），共 32 进程
mpirun -mca btl_tcp_if_include eth0 --map-by ppr:16:node:PE=5 --bind-to core \
       cp2k.psmp -i Ac.inp -o test.out

Step 4. 提交作业；

2个80核心节点启动160个并行任务。

sbatch -p c-80-4 -N 2 -n 160  -c 1 cp2k.sh

查看作业运行情况及参数详细介绍请点击查看slurm命令。

结果文件下载请查看Linux数据传输。

点击下载以上作业样例：CP2K.zip