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北鲲云、亚马逊云科技联合赞助天津大学于iGEM斩获金奖!
发布时间:2022-12-02
信息来源:北鲲云

iGEM:国际基因工程机器大赛是合成生物学领域的国际顶级大学生科技赛事,由美国麻省理工学院于2003年创办。国际基因工程机器大赛赛况和研究成果每年都受到《科学》、《自然》、《科学美国人》、《经济学人》等顶级学术杂志的关注并进行专题报道,具有广泛的国际影响力。



2022年10月28日,国际基因工程机器大赛(International Genetically Engineered Machine Competition, iGEM)2022全球总决赛落下帷幕,在本次大赛中,北鲲云与亚马逊云科技联合赞助天津大学生命科学学院团队TJUSLS_China参赛并斩获金奖(Gold Medal)。


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今年 TJUSLS_China 团队的研究对象是 Proteinase K(蛋白酶 K)。目前商业化的 Proteinase K 产品大都面临钙离子依赖性及不耐热的问题。TJUSLS_China 团队2022年的项目利用合成生物学的方法设计生产出了既不依赖钙离子,常温下热稳定性也显著增强的 Proteinase K 突变体(Capsid ripper)。以上项目研究成果得到了大赛评委及专家的高度评价,特别是对队伍提出的新颖蛋白质设计策略予以了充分肯定。

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在项目的建模部分,团队需要使用 AlphaFold 2和GROMACS两款软件,此过程既需要 GPU 算力,也需要 CPU 算力。算力不足,服务器连接困难、难以并行运算等多个问题导致项目进度缓慢。


项目实现过程中,北鲲云与亚马逊云科技为团队提供了有力的平台支持和充足的算力支持,北鲲云基于通用、便捷、智能的作业调度系统和公共服务,为上层应用提供技术保障,亚马逊云科技则为团队提供了强大HPC云端算力。两者融合,共同发力打造一站式高性能计算平台,提供稳定、高效、安全的计算服务,为团队取得好成绩奠定了坚实基础。


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团队在计算过程中,无需改变平时使用习惯,软件开箱即用,在SSH连接方式中通过Slurm命令即可轻松提交任务。极易上手的平台操作大大提高工作效率。在算力资源方面,主要选择了32核Intel Xeon(Cascade Lake) Platinum 8269/8269CY,在保证运算速度的同时大大的降低了成本。在时间紧张时,最高选择了192核Intel Xeon Platinum (Cooper Lake) 8369 3.3 GHz/3.8 GHz进行运算,极大的缩短了计算时间。


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北鲲云在高性能计算领域,除赞助团队外也与各大高校和中国计算机学会等多个学会保持紧密往来,目前已成功服务近300+高校,北鲲云鼓励各行业科技创新和技术赋能,希望在与云计算相关的前沿领域占据先机,在各大细分领域深耕,成为创新的有力支撑,共同推动行业蓬勃发展。


关于TJUSLS_China团队


2022 TJUSLS_China 团队由来自天津大学生命科学学院本科生张文君、李哲涛、林沁婷、 姜逸飞、吴俊腾、姚云逍、岳晓妍、袁培雄、肖小月、王美晨;精仪学院本科生董译璠、刘欣蔚;药学院本科生姜露晨;微电子学院本科生刘诗杨;自动化学院本科生王睿宁、杨子健;智算学部俞林昊、马欣辰等共同组成。生命科学学院王泽方教授、肖云杰副研究员担任指导老师, 生命科学学院研究生王珅,生命科学学院本科生陆言骄也对今年的项目做出了重要贡献。


说在最后,我们欢迎有类似需求的鲲友来找我们呀~联系大鱼即可了解赞助相关事宜!


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